Valitse alueesi

Valitse alue, joka parhaiten vastaa sijaintiasi tai mieltymyksiäsi.

Valitse sivuston kieli

Tämä asetus hallitsee käyttöliittymän kieltä, mukaan lukien painikkeet, valikot ja kaikki sivuston tekstit. Valitse haluamasi kieli parhaan selauskokemuksen saamiseksi.

Valitse kielet työpaikkailmoituksille

Valitse kielet työpaikkailmoituksille, jotka haluat nähdä. Tämä asetus määrittää, mitkä työpaikkailmoitukset näytetään sinulle.

Mohammed VI Polytechnic University

CBS - Postdoctoral Research Fellow in Antimicrobial Resistance and Resistome Mapping

Unspecified
Tallenna työpaikka

Tietoja työnantajasta

Mohammed VI Polytechnic University is an institution oriented towards applied research and innovation with a focus on Africa.

Käy työnantajan sivulla

Institution/Department

Mohammed VI Polytechnic University
Chemical & biochemical sciences.green process engineering
Research Unit on Microbiome and Host-Pathogen Interactions

Project Overview:

We are looking for a highly motivated Postdoctoral Research Fellow to join our interdisciplinary team focused on antimicrobial resistance (AMR). The selected candidate will have a vital role in an innovative project that aims to map the resistome and clarify the mechanisms of multidrug resistance across diverse microbiomes—comprising clinical, environmental, and host-associated microbial communities. This project seeks to comprehend how antimicrobial resistance genes (ARGs) disseminate within microbial populations via horizontal gene transfer (HGT) and mobile genetic elements (MGEs) and how these processes affect human health, particularly regarding colorectal cancer (CRC).

Key Responsibilities:

  • Perform shotgun metagenomics and whole-genome sequencing (WGS) on microbial samples from various environments (clinical, environmental, tumor-associated microbiomes).
  • Develop and implement bioinformatics pipelines for resistome, mobilome, and virulome profiling using tools such as MEGARes, CARD, VFDB, and PlasmidFinder.
  • Investigate horizontal gene transfer (HGT) dynamics and plasmid-mediated dissemination of ARGs across microbial communities.
  • Conduct phylogenetic and comparative genomic analyses to uncover the evolution of multidrug resistance in pathogenic bacteria.
  • Analyze co-occurrence networks between resistance genes, virulence factors, and mobile elements in microbiome datasets.
  • Collaborate with clinical partners and microbiome researchers to integrate multi-omics data for comprehensive resistome analysis.
  • Publish high-quality research articles and present findings at international conferences.
  • Contribute to grant writing and development of new research proposals.

Required Qualifications:

  • PhD in Microbial Genomics, Bioinformatics, Molecular Microbiology, Infectious Disease Biology, or a related field.
  • Proven experience with high-throughput sequencing technologies (Illumina, Nanopore) and metagenomic analyses.
  • Strong background in bioinformatics tools for microbiome analysis (QIIME2, Kraken2, MetaPhlAn) and AMR gene identification (MEGARes, CARD, ResFinder).
  • Proficiency in Python, R, or Perl, with experience in Linux/Unix environments.
  • Solid understanding of antimicrobial resistance mechanisms, horizontal gene transfer, and mobile genetic elements.
  • Evidence of scientific publications in peer-reviewed journals.
  • Excellent communication and teamwork skills.

Preferred Qualifications:

  • Experience in clinical microbiome research, oncology microbiomes, or environmental resistome surveillance.
  • Familiarity with spatial metagenomics, single-cell microbiome analysis, or multi-omics data integration.
  • Knowledge of machine learning approaches for resistome prediction or biomarker discovery is a plus.

Why Join Us?

  • Access to cutting-edge technologies (mass spectrometry, next-gen sequencing, high-performance computing).
  • Work on high-impact research addressing one of the urgent challenges in global health—antimicrobial resistance.
  • Collaborate with a multidisciplinary team of microbiologists, bioinformaticians, clinicians, and data scientists.
  • Opportunity to lead high-profile publications and contribute to international consortia.
  • Career development support, including grant writing, conference funding, and training opportunities.

Application Process:

Applicants should submit the following in a single PDF file:

  1. A Cover Letter explaining their interest and fit for the position
  2. A detailed Curriculum Vitae (CV)
  3. Names and contact details of 2–3 references
  4. Up to three key publications (optional)

Hae tehtävää

Täytä alla oleva lomake hakeaksesi tätä tehtävää.
Lataa CV ja liitteet*

*Hakemalla työpaikkaa verkoston sivuilla hyväksyt ehdot ja tietosuojakäytäntömme.

Lähettämällä tämän hakemuksen hyväksyt, että säilytämme henkilötietojasi palveluun liittyviä tarkoituksia varten. Arvostamme yksityisyyttäsi ja käsittelemme tietosi turvallisesti. Jos haluat tietojesi poistamisen, ota suoraan yhteyttä meihin.

Lisätietoa työpaikasta

Otsikko
CBS - Postdoctoral Research Fellow in Antimicrobial Resistance and Resistome Mapping
Sijainti
Lot 660, Hay Moulay Rachid Ben Guerir, Morocco Benguerir, Marokko
Julkaistu
2025-04-25
Viimeinen hakupäivä
Unspecified
Työpaikan tyyppi
Tallenna työpaikka

Lisää työpaikkoja tältä työnantajalta

Näytetään työpaikkoja kielillä Englanti, Espanja Muuta asetuksia

Tietoja työnantajasta

Mohammed VI Polytechnic University is an institution oriented towards applied research and innovation with a focus on Africa.

Käy työnantajan sivulla

Kiinnostavia artikkeleita

...
Forecasting the Future of Water University of Oulu 4 min arvioitu lukuaika
...
Speeding Up DNA Analysis With String Algorithms Centrum Wiskunde & Informatica (CWI) 4 min arvioitu lukuaika
...
Conserving Coral Reefs: The Backbone of Marine Biodiversity NIOZ Royal Netherlands Institute for Sea Research 4 min arvioitu lukuaika
...
The Tiny Algae That Fuel The Marine Food Chain NIOZ Royal Netherlands Institute for Sea Research 4 min arvioitu lukuaika
Lisää artikkeleita